Питон, биоинформатика

Цена договорная
18 ноября 2022, 18:06 • 3 отклика • 29 просмотров
Создать функцию, принимающую в качестве аргументов два целых числа n и m, которая возвращает в качестве результата список, заполненный случайно сгенерированными нуклеотидными последовательностями длины не больше m. Вывести эти последовательности на экран (максимум 60 символов в строке), вывести их GC-состав, является ли последовательность транскрибируемой. Если да, то вывести ее аминокислотную последовательность. Все это записать в файл. Для транскрибируемых последовательностей сгенерировать график scatter, где Х - id последовательности, Y - ее GC состав.
codon_table = {'GCU': 'A', 'GCC':'A', 'GCA':'A', 'GCG':'A', 'CGU':'R', 'CGC':'R', 'CGA':'R', 'CGG':'R', 'AGA':'R', 'AGG':'R', 'UCU':'S', 'UCC':'S', 'UCA':'S', 'UCG':'S', 'AGU':'S', 'AGC':'S', 'AUU':'I', 'AUC':'I', 'AUA':'I', 'AUU':'I', 'AUC':'I', 'AUA':'I', 'UUA':'L', 'UUG':'L', 'CUU':'L', 'CUC':'L', 'CUA':'L', 'CUG':'L', 'GGU':'G', 'GGC':'G', 'GGA':'G', 'GGG':'G', 'GUU':'V', 'GUC':'V', 'GUA':'V', 'GUG':'V', 'ACU':'T', 'ACC':'T', 'ACA':'T', 'ACG':'T', 'CCU':'P', 'CCC':'P', 'CCA':'P', 'CCG':'P', 'AAU':'N', 'AAC':'N', 'GAU':'D', 'GAC':'D', 'UGU':'C', 'UGC':'C', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q', 'GAA':'E', 'GAG':'E', 'CAU':'H', 'CAC':'H', 'AAA':'K', 'AAG':'K', 'UUU':'F', 'UUC':'F', 'UAU':'Y', 'UAC':'Y', 'AUG':'M', 'UGG':'W', 'UAG':'STOP', 'UGA':'STOP', 'UAA':'STOP'}
Отзывы
Александр - отличный исполнитель, компетентен в своей области, заказал бы еще проект и не один!
1 год назад
Благодарю, с Вами приятно работать. На все необходимые вопросы получил ответ. В дальнейшем готов к сотрудничеству.
1 год назад