Возможные инструменты:
tungsten-replicator https://github.com/vmware/tungsten-replicator
symmetricds http://www.symmetricds.org/
или аналогичный который подойдет под задачу

Есть несколько баз данных источника:

• mysql-1


• mysql-2


• postgres-1


• ...etc

Каждая база данных содержит набор таблиц (имена таблиц могут пересекаться), например:

• user


• item


• order


• ...etc

Нужно все таблицы в базах данных объединить в одну базу.

В данном случае должно получиться следующее:

База данных:

• postgres-common

Таблицы:

• mysql-1_user


• mysql-1_item


• mysql-1_order


• mysql-2_user


• mysql-2_item


• mysql-2_order


• postgres-1_user


• postgres-1_item


• postgres-1_order

Также нужно настроить механизм фильтрации данных (tungsten-replicator и symmetricds его поддерживают), например имеем номер телефона в базе источнике +7 (111) 222-33-44, нужно что бы в общей базе оказался номер 71112223344 (саму логику преобразования описывать не надо, нужно настроить сам механизм работы)