Нужно реализовать интеграцию whatsapp с почтой или с виджетом jivosite
При отправке сообщения на whatsapp сообщение переадресовывается на почту, с захватом данных отправителя, при ответе на него отправляется в нужный чат whatsapp (для идентификации необходимого чата в теме сообщения можно использовать ID)

Вижу несколько вариантов реализации:
1 Cамый простой использовать апи сторонних сервисов таких как:
http://help.wazzup24.com/ru/api-dlya-integracij/
https://chat2desk.com/
2 Использовать Whatsapp Buisenes api (требует изучения)
https://www.whatsapp.com/business/api
3 переадресовывать через официальное или не официальное приложение.

Возможно есть еще варианты...

Виджет jivosite можно получить тут:
https://www.jivosite.ru/features/
Так же можно изучить их api:
https://www.jivosite.ru/api/