Задача следующая:
При добавлении 2FA к аккаунту гугл через Google Authentificator, сайт гугла выдаёт QR код.
Как человек поступает в данной ситуации? Сканирует QR в приложении и получает новый код каждые 15-30 секунд.

Необходимо реализовать такое же, но только без телефона.
Вариант реализации добавления кода в базу два: через загрузку скриншота с QR кодом, либо через фразу.

Затем при обращении к методу с параметром (к какому аккаунту требуется код) выдавать код, который актуален в данный момент.

Выбор варианта реализации добавления кода в БД на усмотрение исполнителя. БД нужна, т.к. коды генерироваться будут не для одного аккаунта.
Реализация либо на PHP + MySQL, либо python + MySQL, либо ваш вариант