Разработать код в Perl для работы с базой данных Ensembl
750 руб.за час
Добрый день,
мне нужен код в Perl, который бы из базы данных Ensembl создал бы мне файл, со списком синтенических регинов (syntenic regions) между геномом человека (homo sapiens) и геномом мыши (mus musculus). Эти данные я могу увидеть на их сайте, но из-за большого размера не могу их скачать большинство (https://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Location/Synteny?r=8:26291508-26372680;otherspecies=Mus_musculus). Их API именно для этой функции идентификации синтенических регинов при помощи pairwise genome alignment доступен, к сожалению для меня, только в языке Perl (https://asia.ensembl.org/info/docs/api/compara/index.html#api).
Какие данные мне нужны о синтенических регионах:
1. Полная нуклеотидовая секвенция синтенических регинов в геноме мыши
2. Локация начала и конца соответствующего синтенического региона в геномы мыши
3. Если возможно, локация начала и конца оответствующего синтенического региона в геномы человека
По Вашему желанию, могу созвониться по видеозвонку, чтобы в подробностях описать задачу. Цену и срок можно обговорить.
мне нужен код в Perl, который бы из базы данных Ensembl создал бы мне файл, со списком синтенических регинов (syntenic regions) между геномом человека (homo sapiens) и геномом мыши (mus musculus). Эти данные я могу увидеть на их сайте, но из-за большого размера не могу их скачать большинство (https://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Location/Synteny?r=8:26291508-26372680;otherspecies=Mus_musculus). Их API именно для этой функции идентификации синтенических регинов при помощи pairwise genome alignment доступен, к сожалению для меня, только в языке Perl (https://asia.ensembl.org/info/docs/api/compara/index.html#api).
Какие данные мне нужны о синтенических регионах:
1. Полная нуклеотидовая секвенция синтенических регинов в геноме мыши
2. Локация начала и конца соответствующего синтенического региона в геномы мыши
3. Если возможно, локация начала и конца оответствующего синтенического региона в геномы человека
По Вашему желанию, могу созвониться по видеозвонку, чтобы в подробностях описать задачу. Цену и срок можно обговорить.
В заказе есть исполнитель
При переводе заказа из архивного в актуальный, текущий исполнитель будет снят с задачи.
Выберите тип сделки
С безопасной сделкой вы всегда сможете вернуть средства, если что-то пойдет не так. С простой сделкой вы самостоятельно договариваетесь с исполнителем об оплате и берете на себя решение конфликтов.