Надо сделать страницу php которая загружает данные из текстового файла (разделитель символ табуляции) в таблицу 1-я колонка - чекбоксы. При нажатии кнопки в верху страницы запускается sh скрипт, передавая ему в качестве параметра файл со значениями из 2-й колонки для выбраных строчек, по одному значению на строчку. После завершения работы скрипта страница перезагружается из того же файла. Среда Linux SUSE. Всё выполняется под root-ом. Дизайн не важен - минимальный годится.